癌症网 Cell | 人类肿瘤网络图谱(uman Tumor Atlas Network)发布,助力精准医疗!( 三 )
挑战和解决方案
实验设计不可能一步到位,面面俱到。科学家随时准备好B计划甚至C计划。人类肿瘤地图网络的建立计划庞大而有组织,也得到多方的合作和支持。但是发展过程并不顺利,在建立过程中可能会遇到各种问题。首先,代表多个肿瘤进展阶段的样本通常来自不同的患者,因此有必要通过计算来推断进展的途径和机制。其次,图谱反映了不同来源的数据图谱,是针对不同患者的多种技术、多种分析模式的整合。第三,为了评估人类肿瘤图谱网络的预测潜力,需要评估每种肿瘤类型所需的个体和细胞。总的来说,人类肿瘤地图网络将面临的巨大挑战是肿瘤样本来源众多、数据内容多样化、从患者样本中逆向评估和预测所涉及的内容复杂。上述问题的解决方案包括沿家族纵向研究,增加患者样本的采样,优化福尔马林石蜡包埋冷冻样本的处理方法,提高云平台的计算水平。
展览希望
通过构建人类肿瘤图谱网络,整合细胞和空分子分析肿瘤发生、发展和转化的过程,对提高人们对恶性肿瘤的认识和转化医学的应用产生深远影响(图5)。人类肿瘤图谱网络跨越多个空尺度,为临床恶性肿瘤的发展演变、治疗反应、耐药性和特异性分子机制提供了重要平台。
在癌症发展的早期,人类肿瘤图谱有助于识别相关的遗传、表观遗传和环境因素,使癌症患者为战斗做好准备。在晚期癌症中,有助于人们了解癌症转移的驱动因素。同时,人体肿瘤图谱也有助于冷门肿瘤的专业化治疗,拓展了人们对肿瘤的认识。人类肿瘤图谱的建立将对肿瘤的机制研究、诊断过程、预后恢复、治疗检测、药物开发和生物标志物发现产生深远的影响,最终将推动精确医学时代的快速到来。此外,科学家们希望人类肿瘤地图网络将成为一种社区资源,为癌症患者提供基本的医疗解决方案,以了解、诊断、监测和治疗。
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图5 人类肿瘤图谱网络在癌症治疗和制药研究方面的巨大应用潜力图5人类肿瘤图谱网络在癌症治疗和药物研究中的巨大应用潜力
研究人员表示,第一代“人类肿瘤地图网络”可能包括交互式2D和可视化3D,并将关键分子和细胞特征与临床数据元素和患者预后联系起来;第二代肿瘤图谱可以从多参数数据集中获得更多的信息,从而更全面地描述特定肿瘤的遗传、分子、超微结构、细胞和组织学特征等多维信息。对于用户来说,它可以像谷歌地图一样容易找到和使用。 原创https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.03.053
1.了解肿瘤免疫微环境(TIME)进行有效治疗。Nat Med 24,541-550,doi:10.1038/s 14591-018-0014-x(2018)。
2.Srivastava,s .,Ghosh,s .,Kagan,j .癌症前期图谱的制作:承诺、挑战和机遇。癌症趋势4,523-536,doi:10.1016/j . trecan . 2018 . 06 . 007(2018)。
3.人类肿瘤图谱网络团队共享追踪肿瘤转移的策略
https://www . genomeweb . com/sequenting/human-tumor-atlas-network-team-shares-strategy-tracking-tumor-transitions #。Xplzw_03vIW
4.研究尸检揭示的癌症生物学。自然评论。巨蟹座19,686-697,doi:10.1038/s 14568-019-0199-4(2019)。
5.https://humantumoratlas.org/ HTAN计划
https://www . cancer . gov/research/key-initiatives/moon shot-cancer-initiative/implementation/human-tumor-atlas
本文来源于科技日报和BioArt
【癌症网 Cell | 人类肿瘤网络图谱(uman Tumor Atlas Network)发布,助力精准医疗!】
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