HBsAg是筛检HBV感染的常用检测项目，是采用HBsAg的抗体利用免疫测定技术检测HBsAg的a抗原决定簇表位 。当人体感染的HBV表达HBsAg的a抗原决定簇表位的S基因位点发生变异时，它表达的HBsAg的a抗原决定簇表位的氨基酸序列及其构象发生变化，这种“a”抗原决定簇的空间构型改变可逃避野毒株乙肝病毒所诱生的抗HBs的中和作用，产生以下现象：①采用抗HBs试剂检测HBsAg的a抗原决定簇表位可显示HBsAg（－），这种情况在乙肝肝硬化肝移植后长期应用乙肝免疫球蛋白的人群中较为常见（其发生概率有高达28%的研究报告） 。②抗HBs和HBsAg均（－）的慢性HBV感染者（称为：隐匿型慢性乙型肝炎），在一般人群中占1.9%～3.4% 。③HBsAg与抗HBs共存（3%～5%） 。④乙肝疫苗免疫失败 。⑤导致抗HBs不能预防肝移植后HBV再感染 。当感染的HBV含量很低导致其表达的HBsAg含量低于检测范围下限时，虽然有HBV感染也表现为检测阴性 。这种情况在感染HBV后的表达HBsAg的窗口期和慢性非活动性HBV携带者中常可见到 。当感染的HBV表达或分泌HBsAg功能障碍时也可出现实为HBV感染者但检测HBsAg阴性的结果 。上述情况下在筛检献血员和器官移植供体时应增加检测项目，例如增加检测抗HBc和HBVDNA，以提高HBV感染者的检测率 。
所以检测乙肝表面抗原（HBsAg）阴性不能完全排除HBV感染 。
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