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一、根茎区别石菖蒲的根茎粗度为2-5mm左右 ， 并有着淡淡的芳香 ， 它的颜色为淡褐色 ， 根茎是肉质的 ， 上面还有很多的须根 ， 节间的长度通常为3-5mm 。
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水菖蒲的根茎是横走的 ， 粗度是5-10mm左右 ， 同样有芳香 ， 但它是黄褐色的 。它的肉质根是5-6cm左右 ， 须根都是毛发状的 。
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二、叶子区别【石菖蒲与水菖蒲的区别】石菖蒲的叶子是很薄的 ， 是线形的 ， 长度差不多是在20-30cm左右 ， 有时可达到50cm 。它的叶色为暗绿色 ， 无中肋 。
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水菖蒲的叶子是剑状的线形 ， 长度会更长一些 ， 有90-150cm左右 。它的叶子为绿色 ， 十分光亮 ， 有着十分明显的中肋 。
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三、习性区别石菖蒲喜欢在半阴的环境下生长 ， 很害怕被阳光直接照射 ， 喜欢湿润的环境 。
水菖蒲同样喜欢在湿润处生长 ， 它是喜欢温暖的 ， 环境的额温暖度应在20-25℃左右 。
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