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菌群的分布
我们的口腔、鼻腔、胃肠道也都存在着各种不同类型的微生物，其中以肠道中的微生物数量最多、种群最丰富，大约80%的人体正常微生物都集中在这里，它们的数量超过100万亿个（这个数字大约是人体细胞总数的十倍），以细菌为主，种类有四五百种，绝大部分是不需要氧气的厌氧细菌，总重量超过一公斤 。
菌群的产生
人在出生时身体上是没有微生物的，但随后几小时内，微生物便通过呼吸、母乳等各种渠道进入人体、占据合适的位置开始生息繁衍 。并非所有微生物都能在人体顺利定殖，经过8小时一轮的筛选，原意与人体和平共处的微生物被保留下来，成为人体身上的正常菌群 。
肠道菌群的作用
这些细菌生活在肠道并非是多余的，也不是有害的，人体细菌肠道细菌显然也懂得双赢的道理，肠道细菌在享受人体提供的生存空间时自然也感恩戴德 。
抑制外来病原微生物【肠道菌群有哪些作用】 它们能够抑制外来病原微生物，外来病原微生物要想在人体内捣蛋就必须先在人体内找到立足点 。因为有着正常的微生物菌群暂居了生存空间，外来病原微生物要夺取一个立足点必须要和体内原有的菌群竞争，但大部分情况都是这些病原微生物败下阵来 。人体正常肠道细菌以逸待劳自然很容易打败外来的入侵者，从而起到抵御外来病原微生物 。所以只要不“作乱”的肠道细菌都是良民，人体应与其和平共处，若乱用抗生素则会照成失衡，外来细菌容易趁机作乱 。
合成人体所需营养物质 人体正常微生物还能合成一些人体需要的营养物质供人体吸收如维生素合K、维生素B、烟酸等，此外，肠道微生物还有调节人的免疫力、降解食物中亚硝胺等致癌物质的功能 。
菌群失衡易导致患病
同宏观生态系统一样，肠道微生态系统也应保持平衡，这种平衡对于人体健康至关重要，如果肠道微生态平衡被打破，人体或将患病 。例如滥用抗生素常使肠道菌群失调导致腹泻，严重者还可发展为难治的伪膜性肠炎 。抗生素是把双刃剑，能杀死致病菌同样也能杀死很多正常的肠道微生物，继而容易发生肠道微生态失衡 。
也还有许多研究表明肠道微生物失调与自身免疫性疾病、肠易激综合征、肥胖、糖尿病等疾病的发生有关，甚至有研究表明肥胖与肠道内菌群的改变有直接关系 。
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