从理论上说，抗病毒治疗就是应当彻底清除病毒，但实践证明清除病毒是非常困难的 。国际和国内都一致认为治疗乙肝的目标可以分为短期和长期目标 。短期治疗目标是减轻肝脏炎症、预防进展为肝纤维化和(或)肝功能失代偿、确保乙肝病毒DNA持续转阴和肝功复常 。长期治疗目标是阻止肝炎反复发作、预防疾病进展为肝硬化和(或)肝癌、最终延长病人生存期 。在临床实践中，根据可行程度又将治疗目标分为3级 。第一级是理想的治疗目标，即彻底治愈乙肝，其标准是包括乙肝病毒表面抗原、e抗原和乙肝病毒DNA全部转阴，肝组织内免疫组化证实乙肝病毒消失，肝脏炎症、纤维化终止 。依照目前的科学技术水平，尚难以达到这个目标 。第二级是力争实现的治疗目标，即患者经过治疗后获得持续的完全应答，停药后不复发，达到乙肝病毒e抗原与e抗体的血清转换以及乙肝病毒DNA持续阴性 。第三级是更为现实的目标，也是最基本的治疗目标，即通过维持治疗来达到血清病毒转阴或低水平复制和肝功能复常 。依照目前的实际水平，使用各种药物治疗，达到第一级治疗目标非常困难，有可能达到第二级目标，第三级治疗目标则相对容易 。因此，当前可行的抗病毒治疗策略应当是确保达到第三级目标，力争达到第二级目标，通俗的比喻就是“保温饱、奔小康” 。对于乙肝抗病毒治疗不能抱以奢望，目标要现实和可行，这一点需要医务人员清楚，也需要向接受抗病毒治疗的患者交代清楚 。
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