新冠状病毒变异毒株有多少种?如何命名?



新冠状病毒已经来到地球3年多 , 这三年里地球人都在诚惶诚恐地生活 , 裹挟着病毒生活 。 新冠病毒在这个时间段里并不停止活动 , 而是不停变异 , 一次比一次更凶猛 , 一次比一次传染性更大 。



新冠病毒究竟有多少种


新冠病毒属于RNA , 容易发生变异 , 不奇怪!自2019年末以来全球爆发的COVID-19 , 其病原体是新型冠状病毒-2 , 即SARS-CoV-2 。 由于新冠病毒属于RNA病毒 , 像流感病毒一样同属于RNA病毒 , 相对于DNA病毒更加容易变异 。 至今全球至少完成了对330,000株新冠病毒的序列测定 , 发现变异的很多 , 现在一发现变异的新冠病毒株就报道 , 其实有些基因位点的突变意义并不是太大或根本没有什么意义 , 有些突变意义较大 。 一般情况下如果发现新变异的新冠病毒株在全球流行超过了2个月 , 而且新变异的病毒株所占比例的超过整个流行的病毒株的20%或局部流行超过2个月 , 所占比例达到30% , 就认为发现了一个新的病毒株 , 就可以认为新的分枝或进化枝(clade) 。


新冠状病毒变异毒株有多少种?如何命名?

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新冠种病毒分类方法和命名方式


新冠种病毒现在采用希腊字母命名顺序 。 根据测序分析或进化过程 , 以前对于新冠病毒分类有至少4种分类或命名的方法:PANGOLIN法 , 可以分为6种 (A, B, B.1, B.1.1, B.1.177, B.1.1.7);Nextstrain可以分为13 种 (19A–B, 20A–20J and 21A);GISAID分为8种 (S, O, L, V, G, GH, GR, and GV);英国公共卫生机构则用发现变异病毒株的具体时间来分类 , 年月日[YYYY] [MM]/[NN] , 前面加上属于哪一种类型的前缀 , 现在这种分类方法被改成年-月(用英文的前三个字母)-日 , 如VOI-2021-07-08 , 意思是感兴趣的变异株 , 发现于2021年7月8日 。


【新冠状病毒变异毒株有多少种?如何命名?】还有一种人们通常习惯于用变异病毒最早发现国家或地区来命名 , 从2021年7月份起WHO不再用发现国家或地区来命名病毒株 , 因为这样容易引起歧义或带有歧视 , 现在主张采用希腊字母的顺序来命名变异病毒如:Alpha、Beta、Gamma、Delta、Omicron 。


病毒变异后10点观察指标


一般病毒发生变异后需要看变异病毒株是否发生10个方面的变化:增加传染性?增加发病率?增加病死率?降低诊断率?降低对现有的抗病毒药物的敏感性?降低中和抗体的敏感性或临床试验中的药物?容易逃避机体的免疫?容易再次感染?感染已经采用疫苗免疫的个体?增加了多系统炎症反应综合征(MIS)尤其是儿童感染后MIS的发生或导致病程延长?增加了特殊地域、特殊人群的感染率 , 如儿童和免疫缺陷的人群?以上10点中尤其需要重点关注变异病毒是否发生以下3点变化:是否增强传染性?毒力是否增加?是否降低疫苗的保护的有效性?


新冠状病毒变异毒株有多少种?如何命名?

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变异病毒的4大类型 , 至少15种变异病毒株


依据病毒变异后是否具有10条尤其是3条中1条以上 , 可以将变异病毒分为4种类型:值得高度关注变异株(VOHC:Variant Of High Concern)、值得关注变异株(VOC:Variant Of Concern)、感兴趣的变异株(VOI:Variant Of Interest)和需要进一步观察株(VUI:Variant Under Investigation) 。 其中变异病毒如果发生10点中的一点 , 就被称为VUI或VOI , 就需要进一步观察或研究 , 属于VOI变异病毒所占比例增加或独特的暴发特征 , 但在有限的范围或全球有限的范围内流行 。 值得关注的变异病毒株(VOC):变异病毒如果超过了有限的范围或全球有限的范围流行;值得高度关注的变异病毒株(VOHC):变异的病毒株对于有效的干预或预防效果明显下降!

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