苗族医药的起源很早 。 苗族民间有“千年苗医，万年苗药”之说，而苗族医药见诸史籍的时间也很早 。 西汉刘向在《说苑．辨物》中说：“吾闻古之为医者曰苗父 。 苗父之为医也，以营为席，以刍为狗，北面而祝，发十言耳 。 诸扶之而来者，举而来者，皆平复如故 。 ”“苗父”者谁？有的学者认为：“刘向《说苑》说上古有人名苗父，……这个苗父就是黎、苗族的巫师（巫医），巫师治病主要是祈祷禁咒术，但也逐渐用些酒、草等药物”（《中国通史简编》） 。
由于苗族本身无本民族文字和史实的记载，故其医药的起源难于考证，但从众多的其他文献和传说、古歌中，仍可窥知其具体情况，其特点一是起源较早，历史悠久；二是起源于苗族人民生产和生活实践 。 苗族由于生活于药物资源十分丰富的地区，较早地了解和掌握了植物的知识和药用价值 。 至今在苗族地区，几乎每人都能认识掌握几种甚至几十种药物治疗方法，有些地方家家户户门庭院落房前房后皆种植一些常用药物，形成人们应用草药极为普遍的特点，具有“百草皆药，人人会医”之称，史载楚国巫师经常用苗药作巫具，《楚辞》中有不少记有被称为“苗药’、的“菖蒲”和“泽兰”，长沙马王堆一、二号汉墓把“泽兰”作为殉葬品，说明了苗药的历史悠久和广泛应用 。
由于苗族没有本民族文字记载的医籍，这同苗族社会历史发展的各个时期很难确定一样，苗族医药发展无明显的分期 。 但苗医发展史上确实存在一段较长的“巫医合一”的时期，《说苑辨物》上所说的“苗父”属于这种情况，《宋史．蛮夷列传》载：“西南诸夷，汉地，……，疾病无医药，但击铜鼓、铜沙锣以祀神 。 ”苗族人民喜用铜鼓，用它祀鬼神以治病，是较早时期的情况 。
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我国汉族地区在春秋时期，巫与医已经完全分离，但经济科学文化落后的苗族，却比较完全地保存了“巫医合一”的特点 。 道光《凤凰厅志．风俗篇》载：苗族民间“疾病延医服药之外，惟祈祷是务，父母病则延老者，十八人牲牢为请命于神，谓之打十保护 。 童子病则延巫为之解煞，名曰杨关 。 ”这种“巫医合一”的方式，用苗族的俗语来讲，叫做“巫医一家，神药两解”，到清代还很盛行，民国《剑河县志》载：“民知尚稚，笃信鬼神，患病者不事医药治疗，惟气灵于巫祝，有跳神走阴诸名色” 。 民国《兴仁县志》载：“黑苗巫曰密那，遇病延之，杀犬而禳，名曰打老魔 。 ”上述记载很多，除方志外，清．田雯《黔书》载：“苗人……病不服药，惟祷于鬼，谓巫为鬼师，鬼师乘以愚人” 。 清．梁雪绳《黔苗词》中曰：“寨旁岩屋湄边，手携力弩作嬉嬉，病来不解神农药，杀犬屠牛事鬼师 。 ”可见苗族医药中，巫师治疗疾病并非个别现象，而是一个历史现象 。 有的地方延续至今，呈现了十分复杂的情况 。
【苗医发展简史】
苗医外治法还有很大一部分是起源于巫术，虽然它们已完全脱离了巫术的内容与形式，如苗医的滚蛋疗法，最早是巫师敲蛋占卜望鬼时，为加强其法术的神秘性，将煮热的蛋滚动全身而形成 。 滚蛋疗法在苗医中广为流传 。 操作简便，疗效较好 。 更为独特的是，苗医应用滚蛋后蛋壁和蛋黄的颜色变化以诊断并预后疾病，这同巫师敲蛋占卜有着某种联系，构成了苗医的诊法特点 。 其他如化水疗法、踩铧口疗法等，也有类似情况 。
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